Par Vincent Jassey – Chargé de Recherche au CNRS, Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’Environnement (Toulouse)
Les microorganismes jouent un rôle essentiel dans le cycle du carbone des tourbières. Ils sont notamment responsables des émissions de CO2 et méthane et de la séquestration du carbone. De plus en plus, nous prenons conscience que la biodiversité microbienne est menacée par les activités anthropiques et les changements climatiques, notamment dans les tourbières. Afin de comprendre comment surveiller et conserver les microorganismes des tourbières, il est important de faire un état des lieux des cortèges microbiens dans les tourbières françaises et de comprendre leur évolution sur le long terme. Une meilleur compréhension des communautés microbiennes des tourbières a le potentiel de transformer la gestion de ces écosystèmes.
Dans cet optique, je souhaiterais mettre en place un suivi des microorganismes des tourbières de France sur le long terme (5 ans, voir plus). Le but de ce suivi est double. Premièrement, documenter la biodiversité microbienne, taxonomique et fonctionnel, afin de réaliser un bilan et de produire une carte de la diversité microbienne dans les tourbières de France. Deuxièmement, regarder comment ces communautés évoluent sur le long terme afin d’identifier les espèces (et fonctions) à risque, et ce, dans le but préserver et de restaurer ces espèces dans le future.
Via cet appel, je souhaiterais inviter tous les gestionnaires (et/ou propriétaires) à participer à cette étude. La participation à cet effort national est envisagée selon ces principes clés:
1) Chaque participant devra échantillonner quelques grammes de sphaignes dans l’habitat le plus représentatif de sa (ses) tourbière(s) 2 fois par an (fin de printemps et automne) pendant 5 ans. Les échantillons seront pris en triplicats sur les mêmes touffes de sphaignes tous les ans.
2) Les tourbières doivent être en bon état de conservation. Les tourbières de type haut et bas marais sont visées.
3) L’échantillonnage sera effectué via un protocole standardisé que je transmettrai. Je fournirai également les tubes et solutions de préservation pour l’échantillonnage.
4) J’effectuerai les analyses au laboratoire. Deux types d’analyses sont prévues: séquençage ADN des prokaryotes et micro-eukaryotes et quantification des abondances microbiennes.
Je pars du principe selon lequel les données provenant des analyses appartiennent au collaborateur individuel, et à ce titre les données seront transmises à tous les collaborateurs sous la forme qu’il souhaite (données brutes, synthétique). Cependant, les collaborateurs m’autorisent à utiliser ces données à des fins de publications scientifiques. La publication de ces données sous forme d’ensemble de données en libre accès à des fins d’analyses et d’évaluations écologiques à grande échelle, par exemple dans le contexte de bases de données ouvertes, se ferra en consultations avec tous les collaborateurs.
Si vous êtes intéressé, merci de me contacter à l’adresse suivante : vincent.jassey@univ-tlse3.fr
